Französisch-deutsches Verbundprojekt GENDARM:
Gen-Directed re-sensitization of Antibiotic Resistant Microorganisms within complex communities (GENDARM) – Development of bacteriophage-based CRISPR-Cas delivery systems and efficacy testing on multi-drug resistant bacteria in biofilms and in the gut microbiome
Forschungsprojekt NEOGUT:
Functional analysis of gut microbiome-host interactions during the postnatal window of opportunity by a multiscale sequencing approach
Forschungsprojekt PathoSept:
„Durchführung des Vorhabens PathoSept – Entwicklung eines modularen, diagnostischen Komplettsystems zur schnellen Identifizierung von Pathogenen und Antibiotika-Resistenzen bei lebensbedrohlichen Infektionen.“
Das Verbundvorhaben PathoSept beschäftigt sich mit der Entwicklung eines modularen Komplettsystems zur schnellen Diagnostik von lebensbedrohlichen Infektionen. Infektionen mit multiresistenten Erregern zählen heute zu einer der größten Bedrohungen der Gesundheit. Vor allem in Krankenhäusern nehmen Infektionen mit resistenten bakteriellen Erregern stetig zu. Eine der schwersten Infektionen ist die Sepsis, an der allein in Deutschland jährlich mehr als 56.000 Menschen versterben und die zudem immense Krankenhauskosten verursacht. Sepsis „unterscheidet“ nicht nach Geschlecht oder Bevölkerungsgruppe. Jeden kann dieses Schicksal treffen. Die hohe Mortalitätsrate der Sepsis wird durch die lange Zeitspanne zwischen Verdachtsdiagnose und zielgerichteter Therapie, die bis zu fünf Tagen dauern kann, verursacht. Außerdem können Infektionen mit multiresistenten Keimen nicht adäquat behandelt werden. In der Reduktion der Zeit bis zur eindeutigen Diagnose liegt der Schlüssel zum Erfolg.
Die Diagnostik von PathoSept umfasst daher die schnelle Identifizierung des Erregers mittels molekularbiologischer Nachweissysteme sowie die quantitative Bestimmung des Antibiotika-Resistenzprofils. Genetische und phänotypische Methoden zur Diagnostik werden also kombiniert, sodass nach spätestens neun Stunden eine gezielte individuelle Therapie eingeleitet werden kann. Damit hat sich PathoSept zum Ziel gesetzt die Sterberate von Patientinnen und Patienten mit bakteriellen Infektionen und Sepsis signifikant zu verringern, die Neuentstehung und Verbreitung von multiresistenten Keimen zu vermindern und die intensivmedizinischen Kosten drastisch zu reduzieren.
Die Einzigartigkeit des PathoSept-Systems ist die Schaffung eines neuen Workflows, der eine kulturunabhängige Diagnostik ermöglicht. Die Entwicklung des Systems basiert auf einzelnen - jedes für sich genommen - innovativen Modulen. Diese sind: Neue Protokolle zur Separation der Erreger, hochsensitive Assays zur Erregeridentifizierung per qPCR, ein Anzuchtmodul zur kontrollierten Erregervermehrung, ein Wachstumsmonitor zur schnellen Quantifizierung der Resis-tenzen sowie eine nutzerfreundliche und flexibel integrierbare Software. Die nutzerzentrierte Entwicklung unter frühzeitiger Einbindung der Anwenderinnen und Anwender wird ein anwenderfreundliches System mit hoher Nutzerakzeptanz hervorbringen.
